Ответ: Да, можно. Расходы на выплату премии отражаются по КВР 111 "Фонд оплаты труда учреждений" в увязке с подстатьей 211 "Заработная плата" КОСГУ.
Обоснование. Можно выплатить уволенному сотруднику учреждения, если он выполнил все условия и показатели премирования и такая выплата является вашей обязанностью по локальному нормативному акту о премировании, трудовому договору, коллективному договору, нормативным правовым актам, распространяющимся на ваше учреждение, например примерному положению об оплате труда (ч. 2 ст. 57, ч. 1, 2 ст. 135, ч. 1 ст. 144 ТК РФ, п. 2(1) Положения об установлении систем оплаты труда работников федеральных бюджетных, автономных и казенных учреждений).
Премиальные выплаты относятся к выплатам стимулирующего характера и являются составной частью заработной платы работников (Приказ Минздравсоцразвития "Об утверждении Перечня видов выплат стимулирующего характера в федеральных бюджетных, автономных, казенных учреждениях и разъяснения о порядке установления выплат стимулирующего характера в этих учреждениях" от 29.12.2007 РФ N 818, ст. 135 ТК РФ).
Таким образом, исходя из общего правила назначения и выплаты премий по итогам работы при выполнении показателей (достижении результатов труда), установленных условиями премирования, работодатель обязан выплатить премию.
Соответственно, выплата премии отражается по КВР 111 "Фонд оплаты труда учреждений" в увязке с подстатьей 211 "Заработная плата" КОСГУ (п. п. 48.1, 48.1.1.1 Порядка N 85н, п. 10.1.1 Порядка N 209н).
