Ответ: При выходе участника, владевшего долей более 5 лет, НДФЛ не исчисляйте и не удерживайте (ст. 217 НК РФ).
Если срок владения меньше, рассчитайте налог с действительной стоимости доли и удержите его при выплате денег участнику. Перечислить налог надо не позднее следующего дня.
Действительную стоимость доли участника в уставном капитале считайте по формуле (ст. 14 Закона N 14-ФЗ):
Чистые активы определите по последнему бухгалтерскому балансу (ст. 23 Закона N 14-ФЗ).
Имущественный вычет не предоставляйте. Получить его может только сам участник, подав декларацию 3-НДФЛ (ст. 220 НК РФ, Письмо Минфина России от 24.04.2020 N 03-04-05/33258).