Ответ: Издавать два приказа не требуется. Вам не нужно оформлять отпуск по совмещаемой должности. А в документах на отпуск указывайте только основную должность работника. Даже если оформляете ежегодный допотпуск за работу с вредными (2, 3 или 4-й степени) либо опасными условиями труда по совмещаемой должности.
Несмотря на то что эти условия связаны с работой по совмещаемой должности, работник все равно остается работать на той должности, на которую принят согласно трудовому договору. А по совмещаемой он выполняет только определенные обязанности наряду с основной работой. Это следует из абз. 3 ч. 2 ст. 57, ч. 1, 2 ст. 60.2 ТК РФ.
Полезные документы:
Путеводитель по кадровым вопросам. Ежегодный основной оплачиваемый отпуск {КонсультантПлюс}