Ответ: Материалы, а также работы, услуги сторонних организаций, которые нужны подрядчику для выполнения заказа и которые включаются в смету, он может покупать у тех, кто применяет общую систему налогообложения. Соответственно, продавцы дополнительно к цене приобретенных товаров (работ, услуг) предъявят к оплате ему НДС, а он предъявить НДС заказчику не сможет.
Заказчик оплатит стоимость материалов (работ, услуг) без НДС, и в результате этот налог ляжет на плечи подрядчика. Чтобы этого не происходило, в смету отдельной строкой включают дополнительную статью затрат - компенсацию НДС при УСН, чтобы покрыть расходы подрядчика на предъявленный ему НДС.
Документы по данному вопросу из системы КонсультантПлюс:
Готовое решение: Как учесть компенсацию НДС при УСН (КонсультантПлюс, 2023) {КонсультантПлюс}