Ответ: Да, надо.
Обоснование: Сверхнормативные суточные отражаются в расчете 6-НДФЛ, поскольку в части превышения лимита они облагаются налогом (п. 1 ст. 210, п. 1 ст. 217 НК РФ).
Датой фактического получения дохода в виде суточных является последний день месяца, в котором утвержден авансовый отчет по командировке (пп. 6 п. 1 ст. 223 НК РФ). Суточные надо отражать в разд. 2 расчета 6-НДФЛ того отчетного (налогового) периода, на который приходится дата их фактического получения. Удержать исчисленный налог нужно при ближайшей выплате сотруднику дохода, например зарплаты (п. 4 ст. 226 НК РФ).
Документы по данному вопросу из системы КонсультантПлюс: