Имеет ли право бюджетное учреждение частично принимать к вычету НДС на основании одного счета-фактуры, если услуга оплачена частично по КФО 2, частично по КФО 4?

Ответ: бюджетное учреждение вправе принять к вычету НДС с части стоимости услуги, оплаченной по КФО 2, если она выделена в счете-фактуре.

Обоснование: по общему правилу одним из условий для принятия к вычету НДС является правильно оформленный счет-фактура, выставленный поставщиком, а также первичные документы, на основании которых учреждение принимает к учету товары (работы, услуги, имущественные права) (п. п. 1, 2 ст. 169, п. 1 ст. 172 Налогового кодекса РФ).

ИФНС России может отказать покупателю (заказчику) в вычете НДС только при наличии в счетах-фактурах ошибок, которые не позволяют определить (п. 2 ст. 169 НК РФ):

• кто именно является продавцом или покупателем (пп. 2 п. 5, пп. 2 п. 5.1 ст. 169 НК РФ);
• какой именно товар (услуга) или имущественные права приобретены (пп. 5 п. 5 ст. 169 НК РФ, Письмо Минфина России от 14.08.2015 N 03-03-06/1/47252);
• сколько стоят товары (работы, услуги) или какая сумма предоплаты была получена (в авансовом счете-фактуре) (пп. 8 п. 5, пп. 5 п. 5.1 ст. 169 НК РФ);
• ставку НДС (пп. 10 п. 5, пп. 6 п. 5.1 ст. 169 НК РФ);
• сумму налога (пп. 11 п. 5, пп. 7 п. 5.1 ст. 169 НК РФ, Письмо Минфина России от 19.04.2017 N 03-07-09/23491).

Оформление одного счета-фактуры при оплате услуг за счет разных источников финансирования не относится к ошибкам, которые препятствуют вычету НДС, поэтому, если в нем выделена стоимость услуг, оплаченных по КФО 2, учреждение вправе принять сумму НДС с этой части стоимости услуг к вычету (п. 2 ст. 169 НК РФ).

Документы по данному вопросу из системы КонсультантПлюс: Типовая ситуация: Как принять к вычету входной НДС по приобретенным товарам (работам, услугам) (для бюджетной организации) (Издательство "Главная книга", 2026) {КонсультантПлюс}

Готовое решение: Вычеты по НДС (КонсультантПлюс, 2026) {КонсультантПлюс}